下高速收费站的工作人员说是绿通，然后打电话

遇到这种情况，可以通过以下方式解决：

1. 核实情况：查阅当时的验货记录、高速通行记录以及绿通政策文件，确认货物是否真的不符合绿通标准。例如，对照交通运输部办公厅等部门发布的相关文件，查看所运输的农产品是否在绿通目录内，以及是否符合新鲜、未加工等要求。

2. 协商沟通：主动与高速管理部门联系，了解补缴费用的具体依据、金额及期限，同时向其说明当时工作人员认定为绿通的情况，表达自己的立场，尝试通过协商达成和解。

3. 准备证据：若协商无果，要收集所有相关证据，如当时的通行费收据、与工作人员的沟通记录、货物的照片或视频、能证明货物符合绿通标准的文件等，为可能的法律途径做准备。

4. 法律途径：在充分评估成本和胜诉可能性后，可以考虑聘请律师，根据证据情况选择向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁。

如果要提起行政诉讼，需要先判断是否满足行政诉讼的条件。一般来说，如果高速管理部门属于行政机关或法律法规授权的组织，其作出的要求补费的行为属于具体行政行为，且该行为侵犯了你的合法权益，你认为其认定事实错误、适用法律不当或程序违法等，那么在符合法定起诉期限等条件下，可以提起行政诉讼。
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